Francesco PAPPALARDO
FORMAZIONE
Francesco Pappalardo è nato a Catania l’11 marzo 1975. Si è laureato in Informatica con 110/110 e lode nel 2000 presso l’Università di Catania; dopo la laurea, nel 2004 ha conseguito il titolo di Dottore di Ricerca (PhD) in Informatica. Dal 2004 al 2011 è stato assegnista di ricerca presso il Dipartimento di Matematica e Informatica dell’Università di Catania. Nel 2006 è stato visiting researcher presso i Molecular Immunogenetics Labs, IMGT di Montpellier (Francia), mentre nel 2008 è stato visiting researcher presso il Dana-Farber Cancer Institute di Boston (USA).
Francesco Pappalardo è attualmente professore ordinario di Informatica presso il Dipartimento di Scienze del Farmaco e della Salute dell’Università di Catania, dove ricopre anche il ruolo di Vicedirettore del Dipartimento. È inoltre adjunct professor presso la Boston University e l’Health Informatics Research Lab, Department of Computer Science, nonché presso il Menzies Health Institute della Griffith University, Australia.
INCARICHI ISTITUZIONALI
• Responsabile del gruppo di ricerca COMBINE (www.combine-group.org).
• Co-fondatore di Mimesis SRL (www.mimesis.srl).
• Membro del Collegio dei Docenti del Dottorato Internazionale in Basic and Applied Biomedical Science.
• Vicedirettore del Centro di Ricerca per lo Studio, la Prevenzione, la Diagnosi e il Trattamento dei Tumori (CRS PreDiCT).
• Docente di Informatica per la Scuola di Specializzazione in Farmacia Ospedaliera, Università di Catania.
• Docente di Informatica per la Scuola di Specializzazione in Farmacologia Medica, Università di Catania.
• Docente di Informatica per la Scuola di Specializzazione in Microbiologia e Virologia, Università di Catania.
• Docente per la Scuola di Specializzazione in Oncologia Medica, Università di Catania.
• Docente per il Corso di Laurea Magistrale in Chimica e Tecnologia Farmaceutiche.
• Vicedirettore del Dipartimento di Scienze del Farmaco e della Salute, Università di Catania.
Il Prof. Francesco Pappalardo ricopre inoltre i seguenti incarichi:
• Membro dell’ESEC Methodology Working Party della European Medicines Agency.
• Membro del Consiglio Direttivo del VPH Institute (www.vph-institute.org).
• Membro effettivo del tavolo di lavoro “Roadmap for the adoption of in silico medicine”, Ministero della Salute Italiano, 2019.
• Valutatore europeo per il Programma Quadro HORIZON 2020.
• Valutatore europeo per il Programma Quadro HORIZON Europe.
• Valutatore per il Luxembourg National Research Fund (FNR), programma PRIDE.
• Valutatore per la William Harvey International Translational Research Academy.
• Valutatore per l’Institute for Advanced Study dell’Università di Strasburgo (USIAS).
• Revisore per la valutazione di progetti per conto del Ministero dell’Istruzione, dell’Università e della Ricerca.
ATTIVITÀ DI RICERCA
L’attività di ricerca di Francesco Pappalardo è focalizzata sull’applicazione di modelli computazionali nel campo della biomedicina dei sistemi. È uno dei pionieri degli in silico trials, ambito nel quale si occupa attualmente anche degli aspetti regolatori in collaborazione con le autorità europee.
Ha pubblicato oltre 180 articoli su riviste e conferenze internazionali. Svolge attività a servizio della comunità scientifica come presidente e membro di commissioni di programma per prestigiose conferenze internazionali ed è membro degli editorial board di importanti riviste di bioinformatica.
PROGETTI FINANZIATI (SELEZIONE)
• Coordinatore di unità per l’Università di Catania del progetto “Ecosystem for rapid adoption of modelling and simulation METhods to address regulatory needs in the development of orphan and paediatric medicines (ERAMET)”, Progetto della Commissione Europea (HORIZON-HLTH-2023-IND-06), Tipo di azione: RIA - Research and Innovation Action, CONTRATTO n. 101137141.
• Coordinatore di unità per l’Università di Catania del progetto “Novel immunotherapies for tuberculosis and other mycobacterial diseases (ITHEMYC)”, Progetto della Commissione Europea (HORIZON-HLTH-2022-DISEASE-06-two-stage), Tipo di azione: RIA - Research and Innovation Action, CONTRATTO n. 101080462.
• Coordinatore di unità per l’Università di Catania del progetto “ECHO-TWIN (Edge-Cloud-HPC Optimized Twins based on Workflow-enhanced Inference Networks)”, finanziato dal Programma Nazionale Ricerca Innovazione e Competitività 2021-2027 (PN RIC 2021-2027).
• Co-Leader dello Spoke 8 – In Silico Medicine and Omics Data - Programma di ricerca CN00000013 “National Centre for HPC, Big Data and Quantum Computing”.
• Coordinatore Scientifico del progetto In Silico World: Lowering barriers to ubiquitous adoption of In Silico Trials (ISW), Progetto della Commissione Europea (RIA: Horizon 2020 - H2020-SC1-DTH-2020-1, CONTRATTO n. 101016503).
• Coordinatore di unità per l’Università di Catania del progetto 3TR, Progetto della Commissione Europea (H2020-JTI-IMI2-2018-14-two-stage, Tipo di azione: IMI2-RIA - Innovative Medicine Initiative 2 - Research and Innovation Action).
• Coordinatore Scientifico del progetto STriTuVaD, Progetto della Commissione Europea (RIA: Horizon 2020 - H2020-SC1-2017-CNECT-2, CONTRATTO n. 777123).
• Coordinatore di unità per l’Università di Catania del progetto “Case study on use of NAMs to address PFAS immunotoxicity”, finanziato dalla European Food Safety Authority, CONTRATTO n. OC/EFSA/SCER/2021/13.
• Membro del Board del progetto IMMUNOGRID, Progetto della Commissione Europea (STREP: FP6-2004-IST-4, CONTRATTO n. 028069).
• Responsabile Scientifico del progetto MUSS (Mobilità Urbana e Infraurbana Sostenibile) - Bando 2008 per Programmi di Ricerca e Sviluppo - Azione Strategica Innovazione Industriale Mobilità, finanziato dal Ministero dello Sviluppo Economico e dall’Unione Europea (settembre 2012 - marzo 2013).
• Membro del progetto PI2S2, progetto per l’Implementazione e lo Sviluppo di una e-Infrastructure in Sicilia basata sul paradigma Grid, progetto PON.
• Consulente per il progetto VAIMA: Valutazione delle Attività Immunostimolanti di Estratti di Molecole Bioattive da Agrumi, ASSESSORATO REGIONALE DELLE ATTIVITÀ PRODUTTIVE, P.O. FESR 2007/2013 - Asse IV - Misura 4.1.1.1 - Avviso pubblico D.D.G. n. 1703 del 18/06/2010.
• Partecipante al progetto DETECH: Bando 2008 - INDUSTRIA 2015 - Nuove Tecnologie per il Made in Italy. Finanziato dal Ministero dello Sviluppo Economico.
• Partecipante al progetto PON03PE 00216 - Telemedicina, Ambiente e Salute (TAS) e Ion Gantry per Adroterapia (IGH).
L’elenco delle pubblicazioni è disponibile su Scopus:
• https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=15020960900
Per ulteriori informazioni:
• www.combine-group.org
L’attività di ricerca di Francesco Pappalardo è focalizzata sullo sviluppo e sull’applicazione di modelli computazionali avanzati nel campo della systems biomedicine, con particolare riferimento alla medicina in silico, agli agent-based models e ai digital twin biomedici. È riconosciuto a livello internazionale come uno dei pionieri degli in silico trials, contribuendo in maniera significativa alla definizione di metodologie innovative per la simulazione della risposta immunitaria, la modellazione delle malattie e la valutazione virtuale di trattamenti farmacologici e vaccinali. La sua attività scientifica integra modellistica meccanicistica, intelligenza artificiale, high-performance computing e integrazione multi-omica per la realizzazione di piattaforme predittive destinate alla ricerca traslazionale, allo sviluppo farmaceutico e alla medicina personalizzata. In questo contesto guida il gruppo di ricerca COMBINE Group e coordina lo sviluppo della piattaforma UISS (Universal Immune System Simulator), utilizzata in numerosi contesti applicativi che includono immunologia, oncologia, malattie neurodegenerative, malattie infettive e vaccinologia computazionale.
Negli ultimi anni la sua attività si è ulteriormente estesa agli aspetti regolatori della medicina in silico e delle New Approach Methodologies (NAMs), collaborando attivamente con istituzioni e autorità europee per promuovere l’adozione di metodologie di simulazione avanzata nei processi di sviluppo e valutazione di farmaci e dispositivi biomedicali. Ha ricoperto ruoli di coordinamento scientifico e leadership in numerosi progetti europei di elevato impatto, tra cui In Silico World, ITHEMYC ed ERAMET, contribuendo allo sviluppo di ecosistemi digitali per la modellazione biomedica, la simulazione clinica e la validazione di approcci computazionali in ambito regolatorio. La sua ricerca è caratterizzata da una forte componente interdisciplinare e traslazionale, con collaborazioni consolidate con università, centri clinici, industrie farmaceutiche ed enti regolatori internazionali, finalizzate all’integrazione delle tecnologie di simulazione e intelligenza artificiale nei percorsi decisionali della medicina del futuro.
Guida alle tesi di laurea
Francesco Pappalardo svolge da anni un’intensa attività di supervisione e tutoraggio di tesi di laurea triennale, magistrale e di dottorato nei settori dell’informatica, della bioinformatica, della biologia computazionale e della medicina in silico. Le attività di tesi sono orientate a temi altamente innovativi e interdisciplinari, tra cui modellistica computazionale, sistemi immunitari artificiali, intelligenza artificiale applicata alla biomedicina, digital twin, high-performance computing, simulazione di trial clinici in silico e integrazione di dati multi-omici. Numerosi lavori di tesi sviluppati sotto la sua supervisione hanno contribuito a pubblicazioni scientifiche internazionali, progetti europei e collaborazioni con partner accademici, clinici, industriali e regolatori, offrendo agli studenti la possibilità di operare in un contesto di ricerca avanzato e fortemente traslazionale. Gli studenti interessati a svolgere tesi di laurea o attività di ricerca nell’ambito della medicina computazionale, dell’intelligenza artificiale per la salute e delle tecnologie digitali applicate alla biomedicina sono invitati a contattare il gruppo di ricerca COMBINE Group per valutare possibili percorsi di collaborazione e formazione scientifica.